- Descriptio Itineris cisterciensis quod ad comitia generalia ejusdem sacri Ordinis … expedivit F. Joseph Meglinger, religiosus sacerdos monasterii B. Mariae de Maris Stella vulgo Wettingen, mense Maio anni 1667. Lucernae, typis Godefredi Hautt. 268 S. (Ein Abdruck dieses Werkes findet sich bei Migne: Opera S. Bernardi 4. B. Dasselbe behandelt ausführlich Henri Chabeuf in seinem Aufsatz: „Voyage d'un délégué au chapitre général de Cîteaux en 1667“ in den Memoires de l'Academie de Dijon, 1883–1884, S. 169–405. Dijon, Lamarche 1885)
- Nova Melliflui Ecclesiae doctoris sancti Patris Bernardi effigies ex epitome vitae ac selectis epistolis concinnata. Labore et cura
F. Josephi Meglinger etc. Badae Helvetiorum. Per Jacobum Amnion 1671
- Annus Cisterciensis, enthaltend für Tag des Jahres die kurze Lebensgeschichte von Heiligen und Seligen des Zisterzienserordens, in sonderbarer Form, aber schöner lateinischer Diktion, 2 Bände. Verfaßt und gedruckt von P. Joseph Meglinger, 1672 (auch in deutscher Übersetzung bei Straub in Konstanz, 1700: Cistercienser Jahr In welchem Mit andächtigem/ und kurtzem Begriff vorgestellt werden Die sonderbahre Tugenden/ und Ruhmwürdigen Thaten etwelcher Heiligen/ und Seeligen … Deß selben Heiligen … Ordens.)
- Elogia abbatum Maris Stellae 1670 und öfter
- Nemo Peregrinus cujus experimenta de horum temporum cursu narrare exorditur hic liber, 2 Bände, 1687, ²1694 · Duo saecula ferrea (1500–1648), quorum celebrem historiam in praesens contraxit compendium Nemo Peregrinus. 2 Bände. Druck des Verfassers 1689 und 1691 · Offnungen dess Gottshauses Wettingen oder Gerichts-Herrligkeit über die Dörffer Wettingen, Diettikhon, Wirenloss, Spreitenbach, Newenhoff, Kilwangen und Starentschweil. Wettingen 1691
- Grundlicher Beweißthumb deß Kirchensatzes, welchen in der Pfahrkirchen der Loblichen Stadt Baden … ein Gottshaus Wettingen Anno 1406 biß auff diß laufende Jahr eigenthümblich besessen, 1692
- Geometrischer Grundriß aller Marken der Gerichtsherrlichkeit deß Gottshauses Wettingen, 1683
- Archiv des Hochloblichen Gottshauses Wettingen, 1694
- Daneben noch einige kleinere Schriften